مؤسسه بر طبق این قرارداد علاوه بر تأمین دارو و تجهیزات بیمارستانی مورد نیاز این دو مرکز، در تأمین دارو و تجهیزات مورد نیاز بیماران خاص این شهرستان همچون بیماران هموفیلی، تالاسمی، ام اس، پیوندی و... نیز با دانشگاه علوم پزشکی تربت‌حیدریه همکاری می‌کند.
بیمارستان آموزشی و درمانی نهم دی و بیمارستان امام حسین(ع) تربت‌حیدریه دارای بخش‌های مختلف درمانی و تشخیصی بوده و به ترتیب دارای 195 و 102 تخت فعال هستند.